녹내장은 적절히 치료하는데에 있어서 두 가지 중요한점은 치료시기와 치료방법이다. 원발폐쇄각 녹내장과 선천 녹내장은진단 즉시 치료를 시작한다. 개방각녹내장의 경우에는 진행성이거나 병적인 유두함몰이나 특징적인 시야결손으로 시신경손상이 증명되면 반드시 치료를 시작해야한다.

녹내장의증은 시신경손상이 증명되기전에는 언제 치료할것인가를 결정하는데에 의견이 일치되지 않고 있다. 대부분의 전문가들이 말하는 시신경 손상의 위험성이 높은 인자로는 현저한 안압상승, 녹내장의가족력,근시, 당뇨병, 심혈관질환, 인종(흑인은 위험성이 높음), 비대칭적 유두함몰, 큰 유두 함몰, 초기의 비특이성 시야변화등이 있다.

약물치료의 목표는 시신경손상을 일으킬 수 있는 수준 이하로 안압을 하강시키는것이다. 일반적으로 이 목표를 달성시키면서위험성이 가장 낮고, 부작용은 거의 없고, 환자의 일상생활에 지장을 가장 적게 주는 치료법이 시행되어야 한다. 동공차단폐쇄각 녹내장이나 선천녹내장의 경우에는 약물요법이 부수적인 역할을 하지만 원발개방각 녹내장이나 속발녹내장에 있어서 일차적인 치료는 대개 약물요법이며 약물요법이 실패하거나 잘 견디지 못할때에는 수술이 필요하다.